1. «Χημική σύσταση του κυττάρου», οι φοιτητές θα είναι σε θέση:

• να γνωρίζουν τις βασικές κυτταρικές δομές & μακρομόρια, τα οποία παίζουν καθοριστικό ρόλο στη λειτουργία των μικροοργανισμών

2. «Εισαγωγή στη μικροβιολογία», οι φοιτητές θα είναι σε θέση:

• να κατανοούν βασικές έννοιες μικροβιολογίας & ορισμούς
• να γνωρίζουν τις βασικές κατηγορίες μικροοργανισμών, οι οποίοι βρίσκονται στο περιβάλλον
• να γνωρίζουν τα δομικά & λειτουργικά συστατικά των μικροοργανισμών
• να γνωρίζουν την εξελικτική πορεία των μικροοργανισμών
• να παρατηρούν μικροοργανισμούς στο μικροσκόπιο κατόπιν κατάλληλων χειρισμών, μέσω των αντίστοιχων εργαστηριακών ασκήσεων

3. «Μεταβολισμός ετερότροφων μικροοργανισμών», οι φοιτητές θα είναι σε θέση:

• να γνωρίζουν βασικές έννοιες και μηχανισμούς όσον αφορά στο μεταβολισμό των μικροοργανισμών
• να κατανοούν κύρια μεταβολικά βιοχημικά μονοπάτια

4. «Θρέψη, φυσιολογία & ανάπτυξη μικροοργανισμών», οι φοιτητές θα είναι σε θέση:

• να γνωρίζουν τις συνθήκες υπό τις οποίες δύνανται να αναπτυχθούν οι μιρκοοργανισμοί
• να αναπτύσσουν μικροοργανισμούς στο εργαστήριο κατόπιν καλλιέργειας & αντίστοιχων αναλύσεων περιβαλλοντικών δειγμάτων
• να κατατάσσουν τροφικά τους ποικίλους περιβαλλοντικούς μικροοργασνιμούς
• να γνωρίζουν τις φάσεις μικροβιακής ανάπτυξης
• να καταμετρούν τη μικροβιακή ανάπτυξη με ποικίλες μεθόδους στο εργαστήριο

5. «Μικροοργανισμοί ως βιογεωχημικοί παράγοντες», οι φοιτητές θα είναι σε θέση:

• να γνωρίζουν το ρόλο των μικροοργανισμών κατά τη διενέργεια των βιογεωχημικών κύκλων

6. «Μικροβιολογία υδάτινου περιβάλλοντος (Νερό – λύματα)», οι φοιτητές θα είναι σε θέση:

• να γνωρίζουν πώς διενεργείται η εκτίμηση της μικροβιολογικής ποιότητας των υδάτων & των υγρών αποβλήτων
• να γνωρίζουν ποιοι είναι οι μικροβιολογικοί δείκτες ποιότητας του υδάτινου περιβάλλοντος σύμφωνα με την ισχύουσα νομοθεσία
• να διενεργούν μικροβιολογικές αναλύσεις νερού & υγρών αποβλήτων
• να γνωρίζουν τα βασικά στάδια επεξεργασίας υγρών αποβλήτων & το ρόλο των μικροοργανισμών σε αυτά
• να γνωρίζουν τους κύριους τρόπους επαναχρησιμοποίησης επεξεργασμένων αποβλήτων

7. «Απολύμανση», οι φοιτητές θα είναι σε θέση:

• να γνωρίζουν τις κύριες μεθόδους απολύμανσης νερού & υγρών αποβλήτων
• να γνωρίζουν τη συμπεριφορά των ποικίλων μικροοργανισμών κατά τη διενέργεια τεχνικών απολύμανσης
• να γνωρίζουν σε ποιο βαθμό απομκρύνονται οι παθογόνοι μικροοργανισμοί κατά την επεξεργασία υγρών αποβλήτων

8. «Εφαρμογές μικροοργανισμών», οι φοιτητές θα είναι σε θέση:

• να γνωρίζουν τις βασικές εφαρμογές των περιβαλλοντικών μικροοργανισμών ως προς τη βιοαποδόμηση ξενοβιοτικών χημικών ενώσεων

• Αναζήτηση, ανάλυση και σύνθεση δεδομένων και πληροφοριών, με τη χρήση και των απαραίτητων τεχνολογιών
• Ομαδική εργασία
• Σεβασμός στο φυσικό περιβάλλον
• Εργασία σε διεπιστημονικό περιβάλλον

1. Χημική σύσταση του κυττάρου
2. Τα μόρια του κυττάρου
3. Εισαγωγή στη Μικροβιολογία
4. Κυτταρική δομή
5. Προκαρυωτικοί μικροοργανισμοί
6. Ευκαρυωτικοί μικροοργανισμοί
7. Ιοί
8. Εξελικτική πορεία μικροοργανισμών – Βιολογική εξέλιξη & δημιουργία της ζωής
9. Μεταβολισμός ετερότροφων μικροοργανισμών
10. Θρέψη και φυσιολογία μικροοργανισμών
11. Μικροβιακή ανάπτυξη
12. Μέτρηση της μικροβιακής ανάπτυξης
13. Μικροοργανισμοί ως βιογεωχημικοί παράγοντες
14. Μικροβιολογία υδάτινου περιβάλλοντος (Νερό – λύματα)
15. Μικροβιολογική ποιότητα υδάτων
16. Εξυγίανση προβλημάτων κοπρανώδους μόλυνσης των υδάτων – προστασία περιβάλλοντος
17. Βιολογικός Καθαρισμός Αστικών Αποβλήτων
18. Απολύμανση
19. Απομάκρυνση παθογόνων μικροοργανισμών κατά την επεξεργασία των λυμάτων
20. Άλλοι τρόποι εξυγίανσης των λυμάτων και της ενεργού ιλύος
21. Επαναχρησιμοποίηση Επεξεργασμένων Αποβλήτων             
22. Ιοί Εντερικής προέλευσης στα λύματα
23. Παράγοντες που επηρεάζουν την επιβίωση των ιών στο περιβάλλον            
24. Τύχη των παθογόνων μικροοργανισμών στο έδαφος
25. Εφαρμογές μικροοργανισμών

Ι. Γραπτή τελική εξέταση θεωρίας (60% τελικού βαθμού) που περιλαμβάνει:

• Συγκριτική αξιολόγηση στοιχείων θεωρίας
• Επίλυση προβλημάτων σχετικών με ποσοτικά δεδομένα

ΙΙ. Βαθμός εργαστηρίου (40% τελικού βαθμού) που περιλαμβάνει:

• Γραπτή τελική εξέταση (40% βαθμού του εργαστηρίου)
• Αξιολόγηση ομαδικών εργασιών (60% βαθμού του εργαστηρίου)

• BROCK ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΤΩΝ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΩΝ - Κωδικός Βιβλίου στον Εύδοξο: 77106995, Έκδοση: 1η/2018, Συγγραφείς: M.T. Madigan, J.M. Martinko, K.S. Bender, D.H. Buckley, D.A. Stahl. ISBN: 978-960-524-523-8 ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΑΚΕΣ ΕΚΔΟΣΕΙΣ ΚΡΗΤΗΣ.
• ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΗ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ, Κωδικός Βιβλίου στον Εύδοξο: 22758184,  Έκδοση: 2012, Συγγραφείς: Σ. Ντούγιας, Α. Αϊβαζίδης, Π. Μελίδης. ISBN13 9789608002661. ΕΚΔΟΣΕΙΣ ΕΜΒΡΥΟ.
• Σημειώσεις Περιβαλλοντικής Μικροβιολογίας, E-class (παρουσιάσεις) & Σημειώσεις εργαστηριακών ασκήσεων.
• ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY - Συγγραφείς: R.M. Maier, I.L. Pepper, C.P. Gerba. ISBN-13: 978-0-12-497570-5, ISBN-10: 0-12-497570- ACADEMIC PRESS.